Protein–RNA interactions for Protein: O00231

PSMD11, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD11O00231 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD11O00231 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD11O00231 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms