Protein–RNA interactions for Protein: E5RIL1

UPK3BL2, Uroplakin-3b-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL2E5RIL1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPK3BL2E5RIL1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPK3BL2E5RIL1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms