Protein–RNA interactions for Protein: B3SHH9

TMEM114, Transmembrane protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM114B3SHH9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM114B3SHH9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM114B3SHH9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM114B3SHH9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM114B3SHH9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM114B3SHH9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM114B3SHH9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM114B3SHH9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM114B3SHH9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM114B3SHH9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM114B3SHH9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM114B3SHH9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM114B3SHH9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM114B3SHH9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM114B3SHH9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM114B3SHH9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM114B3SHH9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM114B3SHH9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM114B3SHH9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM114B3SHH9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM114B3SHH9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM114B3SHH9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM114B3SHH9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM114B3SHH9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM114B3SHH9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM114B3SHH9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM114B3SHH9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM114B3SHH9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TMEM114B3SHH9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TMEM114B3SHH9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms