Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HMGB1P1B2RPK0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGB1P1B2RPK0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms