Protein–RNA interactions for Protein: B0FP48

UPK3BL1, Uroplakin-3b-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL1B0FP48 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPK3BL1B0FP48 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UPK3BL1B0FP48 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPK3BL1B0FP48 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPK3BL1B0FP48 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPK3BL1B0FP48 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPK3BL1B0FP48 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UPK3BL1B0FP48 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPK3BL1B0FP48 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPK3BL1B0FP48 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPK3BL1B0FP48 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPK3BL1B0FP48 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPK3BL1B0FP48 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPK3BL1B0FP48 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPK3BL1B0FP48 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPK3BL1B0FP48 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPK3BL1B0FP48 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPK3BL1B0FP48 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPK3BL1B0FP48 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPK3BL1B0FP48 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPK3BL1B0FP48 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms