Protein–RNA interactions for Protein: A8MUK1

USP17L5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L5A8MUK1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP17L5A8MUK1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP17L5A8MUK1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP17L5A8MUK1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP17L5A8MUK1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP17L5A8MUK1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP17L5A8MUK1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
USP17L5A8MUK1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP17L5A8MUK1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
USP17L5A8MUK1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP17L5A8MUK1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP17L5A8MUK1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
USP17L5A8MUK1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
USP17L5A8MUK1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L5A8MUK1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L5A8MUK1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L5A8MUK1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L5A8MUK1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L5A8MUK1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L5A8MUK1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L5A8MUK1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L5A8MUK1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L5A8MUK1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L5A8MUK1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L5A8MUK1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP17L5A8MUK1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP17L5A8MUK1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
USP17L5A8MUK1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP17L5A8MUK1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP17L5A8MUK1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms