Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
ZNF316A6NFI3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ZNF316A6NFI3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ZNF316A6NFI3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ZNF316A6NFI3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ZNF316A6NFI3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
ZNF316A6NFI3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ZNF316A6NFI3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ZNF316A6NFI3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ZNF316A6NFI3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ZNF316A6NFI3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ZNF316A6NFI3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
ZNF316A6NFI3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ZNF316A6NFI3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ZNF316A6NFI3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ZNF316A6NFI3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ZNF316A6NFI3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ZNF316A6NFI3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ZNF316A6NFI3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ZNF316A6NFI3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ZNF316A6NFI3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ZNF316A6NFI3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ZNF316A6NFI3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ZNF316A6NFI3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
ZNF316A6NFI3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ZNF316A6NFI3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ZNF316A6NFI3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ZNF316A6NFI3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ZNF316A6NFI3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ZNF316A6NFI3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ZNF316A6NFI3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ZNF316A6NFI3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ZNF316A6NFI3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ZNF316A6NFI3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ZNF316A6NFI3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ZNF316A6NFI3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ZNF316A6NFI3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ZNF316A6NFI3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
ZNF316A6NFI3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ZNF316A6NFI3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ZNF316A6NFI3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ZNF316A6NFI3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ZNF316A6NFI3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ZNF316A6NFI3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ZNF316A6NFI3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ZNF316A6NFI3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
ZNF316A6NFI3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ZNF316A6NFI3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ZNF316A6NFI3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ZNF316A6NFI3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ZNF316A6NFI3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ZNF316A6NFI3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms