Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN8

Putative ubiquitin-like protein FUBI-like protein ENSP00000310146, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NDN8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A6NDN8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A6NDN8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A6NDN8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NDN8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NDN8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NDN8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NDN8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NDN8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NDN8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NDN8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NDN8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NDN8 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NDN8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NDN8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NDN8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NDN8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NDN8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NDN8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NDN8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A6NDN8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NDN8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NDN8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NDN8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NDN8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NDN8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NDN8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NDN8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NDN8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NDN8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NDN8 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NDN8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NDN8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NDN8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NDN8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NDN8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NDN8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NDN8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NDN8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NDN8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NDN8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NDN8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NDN8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NDN8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NDN8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NDN8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NDN8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NDN8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NDN8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NDN8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NDN8 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NDN8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NDN8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NDN8 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NDN8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NDN8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NDN8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NDN8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NDN8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NDN8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NDN8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NDN8 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NDN8 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NDN8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NDN8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NDN8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NDN8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NDN8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NDN8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NDN8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NDN8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NDN8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NDN8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NDN8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
A6NDN8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
A6NDN8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
A6NDN8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
A6NDN8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
A6NDN8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NDN8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NDN8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NDN8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NDN8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NDN8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NDN8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NDN8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NDN8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NDN8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A6NDN8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A6NDN8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A6NDN8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A6NDN8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A6NDN8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A6NDN8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A6NDN8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A6NDN8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A6NDN8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A6NDN8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A6NDN8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A6NDN8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms