Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GMNCA6NCL1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GMNCA6NCL1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms