Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
XIRP2A4UGR9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms