Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FRMD3A2A2Y4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FRMD3A2A2Y4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms