Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
A0A0U1RQJ8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms