Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A0U1RQF3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms