Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SF12

CCDC163, Coiled-coil domain-containing 163, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC163A0A0D9SF12 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC163A0A0D9SF12 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC163A0A0D9SF12 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC163A0A0D9SF12 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC163A0A0D9SF12 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC163A0A0D9SF12 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC163A0A0D9SF12 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC163A0A0D9SF12 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC163A0A0D9SF12 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC163A0A0D9SF12 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC163A0A0D9SF12 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC163A0A0D9SF12 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC163A0A0D9SF12 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC163A0A0D9SF12 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC163A0A0D9SF12 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC163A0A0D9SF12 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC163A0A0D9SF12 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC163A0A0D9SF12 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC163A0A0D9SF12 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC163A0A0D9SF12 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC163A0A0D9SF12 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC163A0A0D9SF12 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC163A0A0D9SF12 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC163A0A0D9SF12 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC163A0A0D9SF12 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC163A0A0D9SF12 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC163A0A0D9SF12 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC163A0A0D9SF12 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC163A0A0D9SF12 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC163A0A0D9SF12 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC163A0A0D9SF12 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC163A0A0D9SF12 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC163A0A0D9SF12 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC163A0A0D9SF12 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC163A0A0D9SF12 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC163A0A0D9SF12 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC163A0A0D9SF12 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC163A0A0D9SF12 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC163A0A0D9SF12 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC163A0A0D9SF12 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC163A0A0D9SF12 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC163A0A0D9SF12 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms