Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 DOCK4-204ENST00000428084 7997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 AC022447.5-201ENST00000504817 392 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 DDR1-262ENST00000508312 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 TPT1-AS1-205ENST00000517509 3456 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 NSUN4-204ENST00000474844 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 UGT1A10-202ENST00000373445 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 RIC8A-203ENST00000526104 3703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 TMEM220-201ENST00000341871 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 MTMR3-202ENST00000333027 8906 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 ARPP21-213ENST00000428373 3150 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 AC136475.7-201ENST00000602949 592 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms