Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 APOL2-203ENST00000451256 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 ZNF595-203ENST00000608255 1999 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 HNRNPA1P33-201ENST00000421426 561 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 HSD3B2-206ENST00000543831 1783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 TARS2-205ENST00000438568 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 HINT1-204ENST00000506908 681 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AL137779.3-201ENST00000553295 729 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 SMIM22-206ENST00000589327 629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC12Q8WUD4 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms