Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 NAGA-201ENST00000396398 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 ZNRD1ASP-219ENST00000448093 2296 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 DLGAP4-203ENST00000373907 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 NNT-202ENST00000344920 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 RHBDL2-201ENST00000289248 2129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 GRB10-202ENST00000357271 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 ARMC1-201ENST00000276569 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 ZC3HC1-202ENST00000358303 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 SRGAP3-202ENST00000383836 8656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 NTM-221ENST00000539799 2550 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 SYTL2-206ENST00000389960 4299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 PNMA6F-201ENST00000436629 3348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 BCL2L13-214ENST00000543133 4975 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 RCAN2-202ENST00000330430 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 TMEM107-208ENST00000532998 2358 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 FOSB-206ENST00000586615 3774 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 LTF-201ENST00000231751 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AC005921.3-201ENST00000623774 2151 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 GRHL3-202ENST00000350501 2119 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 GRID1-AS1-203ENST00000630182 2100 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 ITPRIP-202ENST00000337478 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 TNFSF13B-202ENST00000430559 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 ZNF423-201ENST00000262383 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 NLGN3-205ENST00000536169 3863 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AL118511.1-201ENST00000439341 794 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 FAM47A-202ENST00000613251 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 PCGF2-204ENST00000616199 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 FAM157C-201ENST00000563357 1806 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 RFC5-201ENST00000392542 2449 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 SLC5A11-208ENST00000565769 2214 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 POLE3-202ENST00000374171 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 LINC02473-201ENST00000569621 2195 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 FLJ37035-202ENST00000423178 2600 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 SLC25A19-210ENST00000580994 1554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 DRD3-201ENST00000295881 1541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 COPS8-201ENST00000354371 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 MPP2-203ENST00000461854 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 ANKRD18CP-201ENST00000354752 2980 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 SLC8A3-201ENST00000216568 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 RAD1-203ENST00000382038 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 RPL10-204ENST00000424325 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 ACBD5-203ENST00000375901 3685 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 ERCC6L2-201ENST00000288985 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 TSPEAR-204ENST00000614657 4027 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 DLGAP1-212ENST00000515196 5314 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 OR8J1-202ENST00000533152 1320 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 ZNF132-201ENST00000254166 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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