Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 IQCF1-201ENST00000310914 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 UBA3-201ENST00000349511 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 RPS15P5-201ENST00000449885 432 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 FHIT-205ENST00000476844 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AC131009.2-201ENST00000542763 770 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 HMGB1-202ENST00000339872 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 TAF7L-202ENST00000356784 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 ATP6V0D1-218ENST00000602876 1554 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 ZNF772-203ENST00000425074 1601 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 ZNF582-201ENST00000301310 2824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 OR2A25-203ENST00000641663 1741 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 NXPE4-201ENST00000375478 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 FAM157C-201ENST00000563357 1806 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK8P49336 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 FPGT-202ENST00000370898 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 CREB5-202ENST00000396298 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 MIPEPP1-201ENST00000413533 2027 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 GRP-201ENST00000256857 848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 TEPP-201ENST00000290871 1079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 MARCKSL1P2-201ENST00000401037 976 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 SERF2-205ENST00000403425 690 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AC010136.1-201ENST00000450996 568 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AL590094.1-206ENST00000635959 478 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AL590094.1-209ENST00000637260 499 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AL160287.1-203ENST00000637960 1061 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 GMPR2-224ENST00000559910 1562 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 DDC-206ENST00000431062 1620 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 FAM133B-204ENST00000445716 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK8P49336 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 PAK1-215ENST00000530617 3001 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK8P49336 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms