Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 TEX38-204ENST00000564373 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 AL139823.1-201ENST00000641871 1225 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 KIAA0391-211ENST00000605870 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 SEM1-201ENST00000248566 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 KATNAL1-202ENST00000380617 1634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 ZP4-201ENST00000366570 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 DRD3-201ENST00000295881 1541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 STMN1-206ENST00000455785 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 NDUFAF6-201ENST00000396111 1869 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 MKL1-213ENST00000620651 3757 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 SLC26A5-203ENST00000354356 2686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 ZDHHC8P1-202ENST00000418264 1403 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 CR769775.1-203ENST00000399894 579 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 SYCE3-201ENST00000402753 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 LINC02036-201ENST00000415869 910 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 ZNF32-AS2-201ENST00000418966 905 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 LINC01678-202ENST00000424921 475 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 AL133351.2-201ENST00000437718 484 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 PRDX3P2-201ENST00000447051 611 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 SOX2-OT-203ENST00000466034 926 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 TMEM154-202ENST00000504064 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 RPL26-209ENST00000584164 873 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 SOX2-OT-221ENST00000594942 675 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 AC026304.1-201ENST00000597953 561 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 AC022382.1-201ENST00000602768 336 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 SERPIND1-202ENST00000406799 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 DDX19B-208ENST00000563392 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 TRAP1-201ENST00000246957 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 FKBP4P1-201ENST00000507284 1347 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 HNRNPLP1-201ENST00000421896 1501 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 PSMB8-201ENST00000374881 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 SEPT4-223ENST00000583114 1709 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 KRT18P40-201ENST00000599859 1571 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 IP6K2-201ENST00000328631 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 ORC5-203ENST00000447452 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 GZMH-202ENST00000382548 687 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 KDM5C-IT1-201ENST00000412242 755 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 TUBB8P9-201ENST00000422534 1276 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 TUBB8P10-201ENST00000430210 1279 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 AL355500.1-201ENST00000439421 297 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 AC002066.1-201ENST00000446355 514 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 AC008021.1-201ENST00000474180 414 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
EPCAMP16422 AADAC-202ENST00000488869 719 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms