Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 WDR62-203ENST00000401500 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 TMED7-201ENST00000456936 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 PEX1-204ENST00000438045 3329 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 ATL2-201ENST00000378954 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 RNF125-201ENST00000217740 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 ZNF771-204ENST00000566625 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 MAGEL2-201ENST00000532292 4298 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 TRMT1-202ENST00000357720 2142 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 EPS8L3-201ENST00000361852 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 ABCA2-223ENST00000614293 8146 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AC005154.3-201ENST00000419639 1393 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 WWP2-202ENST00000359154 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 KCNQ3-201ENST00000388996 11510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 SERPINA1-205ENST00000404814 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 CBR4-202ENST00000504480 1602 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 ARMC9-215ENST00000614261 4975 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 ABLIM2-206ENST00000447017 2902 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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TMEM225BP0DP42 ABAT-201ENST00000268251 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 LINC01973-201ENST00000374983 4678 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 TXNRD1-202ENST00000388854 4277 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 NR3C1-204ENST00000394466 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 C3orf35-206ENST00000452017 513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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