Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 TMEM94-201ENST00000314256 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 RBMX-201ENST00000320676 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 SIGLEC11-203ENST00000447370 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 EPB41L2-204ENST00000392427 3369 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 PPP4R3A-206ENST00000554943 3369 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 RAB3IP-201ENST00000247833 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 TTI2-204ENST00000520636 1588 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 AMACR-201ENST00000335606 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 PFKFB3-203ENST00000379775 4483 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HMGB1P1B2RPK0 RTEL1-211ENST00000508582 4273 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 MPPE1-204ENST00000344987 1831 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD27-204ENST00000587352 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 FBXW11-201ENST00000265094 4342 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 LINC01801-202ENST00000590963 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 IL1R2-201ENST00000332549 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 PPARA-202ENST00000402126 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 TNRC6C-201ENST00000301624 9632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AP000894.1-201ENST00000584430 520 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 GSN-205ENST00000373823 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 USP20-202ENST00000358355 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 TMCO4-202ENST00000375127 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 RPL10-218ENST00000618723 2210 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 MYADM-204ENST00000391770 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 SLC6A6-210ENST00000622186 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 TMEM18-201ENST00000281017 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 PES1-203ENST00000402281 2760 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 NLRP7-206ENST00000588756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AOC2-201ENST00000253799 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 CLINT1-206ENST00000523094 3987 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP25-201ENST00000409030 2936 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 STXBP1-220ENST00000637521 2068 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 ERI2-208ENST00000564349 3657 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 UBA52-202ENST00000442744 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 ACAD11-204ENST00000481970 1891 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 ARPP21-213ENST00000428373 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 DDX56-204ENST00000431640 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 MATN2-218ENST00000524308 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 ZNF773-205ENST00000599847 5832 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AC120024.4-201ENST00000624285 2143 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 DIP2C-205ENST00000634311 4961 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 SMIM10L1-201ENST00000622602 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 B3GAT2-202ENST00000615536 5206 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms