Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 OR2V2-201ENST00000328275 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 HNRNPA1P3-201ENST00000440968 551 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 TRAPPC4-212ENST00000533058 1209 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZCCHC17Q9NP64 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZCCHC17Q9NP64 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZCCHC17Q9NP64 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZCCHC17Q9NP64 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZCCHC17Q9NP64 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
ZCCHC17Q9NP64 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC17Q9NP64 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC17Q9NP64 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC17Q9NP64 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC17Q9NP64 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC17Q9NP64 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC17Q9NP64 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC17Q9NP64 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC17Q9NP64 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC17Q9NP64 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC17Q9NP64 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC17Q9NP64 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC17Q9NP64 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC17Q9NP64 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC17Q9NP64 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC17Q9NP64 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC17Q9NP64 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC17Q9NP64 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC17Q9NP64 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC17Q9NP64 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC17Q9NP64 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC17Q9NP64 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC17Q9NP64 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC17Q9NP64 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC17Q9NP64 SERF2-205ENST00000403425 690 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC17Q9NP64 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC17Q9NP64 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC17Q9NP64 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC17Q9NP64 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC17Q9NP64 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC17Q9NP64 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms