Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 ERBB2-201ENST00000269571 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 CENPP-201ENST00000375576 3088 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 LRTM1-201ENST00000273286 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 SLC12A8-202ENST00000430155 2831 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 SLC8A3-207ENST00000528359 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 SLC8A3-210ENST00000534137 2837 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 CBLB-203ENST00000403724 3350 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 ESR2-213ENST00000557772 5458 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 ERI2-208ENST00000564349 3657 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 SNIP1-201ENST00000296215 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 AKAP1-208ENST00000572557 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 MRPL44-201ENST00000258383 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 SLC13A2-202ENST00000444914 2855 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 SEMA6A-202ENST00000343348 6878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 SLC5A11-205ENST00000545376 2294 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 ARL4C-201ENST00000339728 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 TUBB8-204ENST00000564130 2438 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 RPL13-201ENST00000311528 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 LRRC8E-206ENST00000618098 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 CELF4-203ENST00000420428 4052 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 FAM78A-202ENST00000372269 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 LINC01428-201ENST00000449581 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 PACRG-AS1-201ENST00000626335 2192 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 PLCXD1-201ENST00000381657 5507 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 CEACAM20-201ENST00000611497 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 AC026904.1-201ENST00000430626 3549 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 GPRASP1-201ENST00000361600 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 CHMP2B-201ENST00000263780 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 AC008758.4-201ENST00000435033 2593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 ZIC4-217ENST00000525172 4152 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 SPTB-202ENST00000389720 6321 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 AC078842.2-201ENST00000447529 1835 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 SLC39A14-204ENST00000381237 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 ERVK13-1-205ENST00000568395 5578 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 IPO7-201ENST00000379719 6191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 POM121L9P-201ENST00000414583 5018 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 SPAG8-201ENST00000340291 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 AC134682.1-201ENST00000569285 3377 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 FP565324.1-201ENST00000636427 3659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 ODF2-213ENST00000448249 2059 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 PLA2G6-203ENST00000402064 3011 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 SLC5A11-202ENST00000424767 2399 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 LINC00563-201ENST00000566370 1400 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NBR1Q14596 LPXN-203ENST00000528954 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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