Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 IGLV2-33-201ENST00000390302 412 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 AL357054.1-201ENST00000407035 1227 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 TFG-202ENST00000418917 1716 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 TAF11-202ENST00000420584 1465 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 AC253536.2-201ENST00000423307 254 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 HLA-DQB3-203ENST00000425319 356 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 AL662860.1-201ENST00000436804 877 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 TSACC-206ENST00000466306 477 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 RN7SL111P-201ENST00000468841 285 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 OR7E26P-201ENST00000502808 1006 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 AC142391.1-201ENST00000515823 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 AC044839.1-201ENST00000532307 541 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 GABARAPL1-203ENST00000535576 792 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 NFKBIA-208ENST00000557140 1400 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 NR2F2-AS1-210ENST00000561344 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 AC006236.1-201ENST00000576249 797 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 RN7SL238P-201ENST00000613832 290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.139-201ENST00000616096 290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 RN7SL106P-201ENST00000618104 290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 CENPK-215ENST00000514814 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 LINC00888-202ENST00000471496 1490 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 ROPN1B-201ENST00000251776 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 KRT18P39-201ENST00000415349 1299 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 AL590068.2-201ENST00000426067 378 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 TUSC8-201ENST00000432701 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 CDK2AP2P2-201ENST00000478512 367 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 AC136475.6-201ENST00000533113 289 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 KRTAP2-2-202ENST00000542910 390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 BCAR1P1-201ENST00000553953 636 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 AL031058.1-201ENST00000561592 888 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 AC109597.2-201ENST00000569407 927 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 AC104423.1-201ENST00000591742 728 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 ATXN10-212ENST00000640901 1185 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 PECR-201ENST00000265322 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 ZNF621-204ENST00000431278 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 MLPH-202ENST00000338530 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 LINC02140-202ENST00000566649 2017 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 MRPL36-201ENST00000382647 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 IGKV6-21-201ENST00000390256 406 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 IGLV3-21-201ENST00000390308 602 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 RNF7-202ENST00000393000 805 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 RN7SKP102-201ENST00000411186 315 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 RPL18P1-201ENST00000497218 552 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 AC092745.1-201ENST00000535746 603 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 AL731555.1-201ENST00000634547 1259 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 CARS-216ENST00000639317 135 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 HDGF-203ENST00000368209 2171 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 TMEM106A-204ENST00000588659 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 TPD52L3-203ENST00000381428 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 MEF2C-207ENST00000503554 1345 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 LINC00685-201ENST00000391707 428 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 CD27-AS1-201ENST00000399492 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 SLC25A6P1-201ENST00000412123 775 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 ALDH7A1-203ENST00000413020 1126 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 AC006987.4-201ENST00000430032 279 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 C3orf35-206ENST00000452017 513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 674 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 VTI1BP1-201ENST00000486325 700 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 AC009238.3-201ENST00000512705 217 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1SQ13698 RPL30-213ENST00000523172 274 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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