Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AC136475.7-201ENST00000602949 592 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 SNORA50D-201ENST00000408059 134 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AC108879.1-201ENST00000438026 828 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms