Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD1P28340 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD1P28340 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD1P28340 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD1P28340 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD1P28340 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD1P28340 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD1P28340 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD1P28340 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD1P28340 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD1P28340 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD1P28340 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
POLD1P28340 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLD1P28340 CD1A-201ENST00000289429 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLD1P28340 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLD1P28340 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD1P28340 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD1P28340 GLT6D1-201ENST00000371763 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD1P28340 GLT6D1-202ENST00000613244 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD1P28340 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD1P28340 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD1P28340 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD1P28340 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD1P28340 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD1P28340 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD1P28340 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD1P28340 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD1P28340 TMIGD1-201ENST00000328886 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD1P28340 PRSS3-203ENST00000379405 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD1P28340 CD33-202ENST00000391796 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD1P28340 AL078621.2-201ENST00000419351 698 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD1P28340 DDTP1-201ENST00000443589 383 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD1P28340 CHIAP2-202ENST00000449687 669 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD1P28340 RN7SL756P-201ENST00000488739 268 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD1P28340 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD1P28340 KCTD14-202ENST00000533144 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD1P28340 AC002519.2-201ENST00000563575 539 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD1P28340 ZNF415-221ENST00000600574 563 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD1P28340 AC007622.2-202ENST00000546714 1680 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD1P28340 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD1P28340 TRIM39-RPP21-201ENST00000623385 1698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD1P28340 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD1P28340 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD1P28340 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD1P28340 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD1P28340 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD1P28340 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD1P28340 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD1P28340 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD1P28340 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD1P28340 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD1P28340 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD1P28340 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD1P28340 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD1P28340 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD1P28340 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD1P28340 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLD1P28340 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD1P28340 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD1P28340 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD1P28340 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD1P28340 AC020741.1-201ENST00000381217 2079 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD1P28340 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD1P28340 HSD3B2-206ENST00000543831 1783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD1P28340 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD1P28340 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD1P28340 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD1P28340 MRPL55-207ENST00000366733 834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD1P28340 RPL19P20-201ENST00000415648 591 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD1P28340 AL049542.1-201ENST00000430231 278 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD1P28340 PLA2G6-213ENST00000447598 567 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD1P28340 NREP-218ENST00000509427 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD1P28340 DHRS7-202ENST00000536410 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD1P28340 AP000439.1-201ENST00000544004 581 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD1P28340 SLIRP-209ENST00000557342 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD1P28340 SLIRP-211ENST00000557623 865 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD1P28340 ALDOA-229ENST00000636698 420 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD1P28340 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD1P28340 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD1P28340 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD1P28340 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD1P28340 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD1P28340 PSMD13-201ENST00000352303 1427 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD1P28340 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD1P28340 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD1P28340 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLD1P28340 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD1P28340 ELMOD3-201ENST00000315658 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD1P28340 CNOT4-204ENST00000414802 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD1P28340 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD1P28340 MRPL43-202ENST00000318325 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD1P28340 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD1P28340 RAP1A-201ENST00000356415 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD1P28340 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD1P28340 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD1P28340 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD1P28340 ST5-258ENST00000534278 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLD1P28340 UPF3B-204ENST00000619445 1385 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms