Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 DRD3-201ENST00000295881 1541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 PAEP-201ENST00000277508 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC12Q8WUD4 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms