Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NESP48681 TMEM253-201ENST00000418511 1526 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NESP48681 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NESP48681 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NESP48681 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NESP48681 STRAP-202ENST00000419869 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NESP48681 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NESP48681 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NESP48681 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NESP48681 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NESP48681 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NESP48681 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NESP48681 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NESP48681 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NESP48681 ZNF621-204ENST00000431278 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NESP48681 GPHA2-201ENST00000279168 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NESP48681 SCLT1-202ENST00000439369 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NESP48681 AC099541.1-201ENST00000453828 670 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NESP48681 AC004217.1-201ENST00000469026 794 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NESP48681 EXOSC1-210ENST00000485122 564 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NESP48681 HOXA-AS2-205ENST00000518088 509 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NESP48681 AC091153.4-201ENST00000570493 480 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NESP48681 AP003028.1-201ENST00000577699 1033 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NESP48681 IGKV1D-13-201ENST00000611391 376 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NESP48681 AL513485.1-201ENST00000617915 845 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NESP48681 PASK-216ENST00000629419 216 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NESP48681 AC012184.3-201ENST00000562077 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NESP48681 ALG8-201ENST00000299626 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NESP48681 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NESP48681 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NESP48681 PPARG-206ENST00000397012 2006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NESP48681 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NESP48681 CFAP206-202ENST00000369562 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NESP48681 TARS2-205ENST00000438568 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NESP48681 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NESP48681 FAM230B-205ENST00000424410 1856 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NESP48681 HACD3-207ENST00000566074 1658 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
NESP48681 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NESP48681 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NESP48681 SPATA22-201ENST00000268981 1280 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NESP48681 HDAC8-201ENST00000373554 833 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NESP48681 LINC02054-201ENST00000419960 885 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NESP48681 AL031770.1-201ENST00000430842 851 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NESP48681 AP000695.2-202ENST00000454980 649 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NESP48681 CIAPIN1P-201ENST00000584883 931 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NESP48681 SRP9-205ENST00000626563 329 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NESP48681 DCUN1D3-202ENST00000563934 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NESP48681 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NESP48681 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NESP48681 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NESP48681 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NESP48681 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NESP48681 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NESP48681 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NESP48681 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NESP48681 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NESP48681 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NESP48681 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NESP48681 NUDT7-201ENST00000268533 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NESP48681 AL354714.2-201ENST00000425270 1097 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NESP48681 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NESP48681 SDHD-204ENST00000528021 1071 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NESP48681 SDHD-205ENST00000528048 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NESP48681 LINC00929-202ENST00000556159 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NESP48681 AC009065.7-201ENST00000561544 580 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NESP48681 NUDT7-205ENST00000564085 899 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NESP48681 MT3-206ENST00000570176 579 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NESP48681 AC127496.2-201ENST00000576859 368 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NESP48681 AC004134.1-201ENST00000587835 225 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NESP48681 LINC01828-205ENST00000594329 863 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NESP48681 AC020728.1-201ENST00000605749 1216 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NESP48681 NUDT7-207ENST00000613075 1073 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NESP48681 AC004494.2-201ENST00000623168 830 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NESP48681 FP236383.2-201ENST00000625598 923 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NESP48681 FP236383.3-201ENST00000627981 923 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NESP48681 FP671120.3-201ENST00000631211 923 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NESP48681 AC025278.3-201ENST00000636139 796 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NESP48681 AC011591.2-201ENST00000636637 786 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NESP48681 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NESP48681 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NESP48681 HMGB2-201ENST00000296503 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NESP48681 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NESP48681 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NESP48681 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NESP48681 PPM1K-201ENST00000295908 1940 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NESP48681 GDA-203ENST00000376986 1771 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NESP48681 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NESP48681 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NESP48681 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NESP48681 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NESP48681 ATP6V1G2-206ENST00000376151 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NESP48681 AP000346.1-201ENST00000390329 1087 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NESP48681 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NESP48681 AL365203.1-201ENST00000450890 1048 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NESP48681 C9orf147-203ENST00000460965 446 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NESP48681 NT5CP1-201ENST00000554092 509 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NESP48681 RN7SL644P-201ENST00000577919 259 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NESP48681 CLEC4M-210ENST00000597522 811 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NESP48681 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NESP48681 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms