Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 GGTA1P-202ENST00000481534 3429 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 ZBTB26-201ENST00000373654 2047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AC006144.1-201ENST00000424220 1600 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AC024560.1-201ENST00000424493 1471 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 TARS2-205ENST00000438568 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 USP36-202ENST00000449938 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AL356130.1-201ENST00000620188 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 C1QTNF6-201ENST00000337843 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 ZYX-203ENST00000392910 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 CYP11B1-204ENST00000517471 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 TRNAU1AP-201ENST00000373830 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 OR8J1-202ENST00000533152 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 MAP2-201ENST00000199940 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 MIS12-202ENST00000573759 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 RNF220-202ENST00000355387 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 GOLGA8A-201ENST00000359187 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERC3Q15034 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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