Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 RN7SL162P-201ENST00000579233 292 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 AC008038.1-201ENST00000634247 1314 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms