Protein–RNA interactions for Protein: P61578

ERVK-16, Endogenous retrovirus group K member 16 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-16P61578 KRIT1-201ENST00000340022 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 TARS2-205ENST00000438568 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 KANSL1-208ENST00000574590 5147 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 PANK2-206ENST00000497424 4815 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 GREM2-201ENST00000318160 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 MLPH-202ENST00000338530 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 TMF1-201ENST00000398559 6849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 SERPINA1-205ENST00000404814 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 DRD3-201ENST00000295881 1541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC11.08□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 HECW1-201ENST00000395891 9501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
ERVK-16P61578 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 PLEKHG4-204ENST00000427155 4455 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 AC080128.2-201ENST00000641520 11863 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 RGS3-207ENST00000374140 4591 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 RBM20-201ENST00000369519 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 ZCRB1-201ENST00000266529 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 OTOG-202ENST00000399391 8778 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 NRP1-201ENST00000265371 5882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ERVK-16P61578 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms