Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AC140481.1-202ENST00000436488 525 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 GOLGA2-210ENST00000490628 428 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AC091057.1-201ENST00000501830 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AC023886.1-202ENST00000504009 477 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 KRT18P63-201ENST00000505463 979 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 LUCAT1-201ENST00000511918 828 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 FAM76A-207ENST00000530324 1027 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AP001775.1-201ENST00000532608 586 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AC069503.1-201ENST00000538710 816 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AC131009.2-201ENST00000542763 770 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AC116553.1-201ENST00000561752 397 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AC022211.3-201ENST00000584339 400 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 CIRBP-AS1-201ENST00000585832 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 EIF3K-213ENST00000593149 760 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 LINC00643-207ENST00000637212 734 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 Z97653.2-201ENST00000623057 1418 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POLD1P28340 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD1P28340 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD1P28340 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD1P28340 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD1P28340 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD1P28340 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD1P28340 PARVA-201ENST00000334956 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD1P28340 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD1P28340 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD1P28340 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD1P28340 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD1P28340 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD1P28340 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD1P28340 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD1P28340 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD1P28340 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD1P28340 MAGEB1-201ENST00000378981 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD1P28340 APOO-201ENST00000379226 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD1P28340 SERF2-210ENST00000409960 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD1P28340 C3orf18-202ENST00000422619 551 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AC007312.1-201ENST00000427493 258 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AC006001.3-205ENST00000428370 579 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AC253536.1-201ENST00000437021 315 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AL353803.1-201ENST00000439014 800 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD1P28340 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD1P28340 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD1P28340 RN7SL483P-201ENST00000478417 285 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD1P28340 MYLK-AS1-203ENST00000485162 587 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AC109830.1-203ENST00000506638 467 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD1P28340 PTMAP5-202ENST00000607242 1162 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD1P28340 OR4C3-202ENST00000611380 597 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AC009118.3-201ENST00000622896 873 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD1P28340 VOPP1-217ENST00000625836 1400 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD1P28340 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD1P28340 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD1P28340 JAML-211ENST00000533261 1508 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD1P28340 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD1P28340 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD1P28340 BHMT2-201ENST00000255192 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD1P28340 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD1P28340 HPGD-204ENST00000504433 1910 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD1P28340 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AC073488.1-201ENST00000416620 1600 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 ALLC-201ENST00000252505 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 SLURP1-201ENST00000246515 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 CDKN2AIPNLP2-201ENST00000274516 352 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 COQ4-202ENST00000372875 928 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 C1orf158-201ENST00000376210 695 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 FKBP1A-201ENST00000381715 705 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 IGHV1-45-201ENST00000390621 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 ANO7-203ENST00000402530 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 CAPG-204ENST00000409724 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AL929472.4-201ENST00000447422 691 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 PRKRIP1-202ENST00000462601 884 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AC093627.3-201ENST00000467050 574 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 LINC02163-201ENST00000514769 574 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 CRYAB-213ENST00000533475 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 LINC02354-202ENST00000548564 573 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 AC013356.4-201ENST00000558421 482 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 LINC02182-201ENST00000569362 498 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POLD1P28340 HP-215ENST00000569639 568 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms