Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AL049597.1-201ENST00000447415 555 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 TCEA3-204ENST00000461794 713 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AC090589.3-201ENST00000524412 574 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AC069503.1-201ENST00000538710 816 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 SELENOK-205ENST00000541726 814 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AL606834.1-201ENST00000553836 1169 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 RAB42P1-201ENST00000555078 316 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 MIR4309-201ENST00000582498 83 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 IFI27-214ENST00000620396 599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AC073592.10-201ENST00000624789 597 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 YAP1P1-201ENST00000401504 1393 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 AP000229.1-201ENST00000608591 1979 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q9Y3F1 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AC004471.2-201ENST00000609936 1514 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 GSTM1-204ENST00000369823 852 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 OBP2A-203ENST00000371776 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 NDUFS5-201ENST00000372967 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 NDUFS5-202ENST00000372969 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 MIR766-201ENST00000390223 111 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 IGHV1-45-201ENST00000390621 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 LINC02036-201ENST00000415869 910 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 CLK2P1-201ENST00000416636 1294 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AL355500.1-201ENST00000439421 297 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 CDK2AP2P2-201ENST00000478512 367 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AL589666.1-201ENST00000503906 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 TRPM1-210ENST00000559179 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 SNHG5-211ENST00000587692 1029 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AC012313.2-201ENST00000599952 1154 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AC008555.6-201ENST00000605047 458 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 LINC00923-208ENST00000621777 503 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AC112702.1-201ENST00000623712 366 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 IKZF3-211ENST00000394189 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 MAFTRR-201ENST00000562921 1859 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 HACD3-207ENST00000566074 1658 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Q9Y3F1 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Q9Y3F1 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 ZNF772-203ENST00000425074 1601 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 ANAPC15-201ENST00000227618 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 SLIRP-201ENST00000238688 394 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 OR4C46-201ENST00000328188 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 LMO1-201ENST00000335790 1279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 BTF3-202ENST00000380591 1237 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AC245128.1-201ENST00000400864 1294 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 JPT1-205ENST00000470924 663 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 PSMD6-209ENST00000482510 1176 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 LMO1-204ENST00000534484 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 IGHV3OR16-11-201ENST00000565524 349 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AC005920.4-201ENST00000573301 492 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9Y3F1 AC090093.1-201ENST00000611315 271 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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