Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 RAB8A-202ENST00000586682 1315 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 NHP2-201ENST00000274606 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 TSPEAR-AS2-201ENST00000330490 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 CD33-202ENST00000391796 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 AL357054.1-201ENST00000407035 1227 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 FTLP16-201ENST00000446400 513 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 RN7SL483P-201ENST00000478417 285 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 AC025419.1-201ENST00000537250 690 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 ORMDL2-204ENST00000550836 438 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 AL139317.2-201ENST00000556998 158 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 HIST1H4K-201ENST00000611927 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 AL590428.1-201ENST00000428865 1973 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 PPP1R8-201ENST00000236412 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 TRMT11-202ENST00000368332 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SIRT1Q96EB6 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 RPS6-201ENST00000315377 863 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 PLPP4-201ENST00000369073 1135 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 TFAM-201ENST00000373895 973 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 GNRH2-203ENST00000380346 353 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 MIR181D-201ENST00000384853 137 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 HNRNPA1P68-201ENST00000425806 979 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AC006001.2-202ENST00000439360 508 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 RN7SL111P-201ENST00000468841 285 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AC092944.1-204ENST00000475102 384 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 SPTY2D1-AS1-202ENST00000511927 573 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AP001360.1-203ENST00000524708 464 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AKR1B1P3-201ENST00000525311 588 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 SLC22A18AS-202ENST00000526203 664 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AP000753.1-201ENST00000542805 573 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AC013356.4-201ENST00000558421 482 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AC103810.4-201ENST00000578601 257 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AC011479.2-201ENST00000598146 432 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 MRPL34-206ENST00000602206 603 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 CREB5-203ENST00000396299 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 NFIX-201ENST00000358552 1727 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 CXorf40B-203ENST00000370406 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 EFNA1-201ENST00000368406 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 KRT40-201ENST00000377755 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 VPS26A-203ENST00000395098 2554 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 LIPC-202ENST00000356113 2161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 TPD52L3-203ENST00000381428 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AC139491.6-202ENST00000637171 2077 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 TRIM15-206ENST00000376688 426 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 RIBC1-203ENST00000414955 1281 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 FTLP3-201ENST00000427242 528 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 FAM157A-201ENST00000437428 1141 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AC006059.1-201ENST00000438017 722 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AC007622.1-201ENST00000488371 535 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 CDK2AP1-204ENST00000538446 1161 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 FP325317.1-201ENST00000539936 1042 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AC015936.1-201ENST00000591013 1028 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 DMRTC1-201ENST00000595412 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AC106774.4-201ENST00000600799 409 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 MIR1914-201ENST00000607800 80 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AL731555.1-201ENST00000634547 1259 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms