Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 TIMP1-201ENST00000218388 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 PRDX1-202ENST00000319248 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 TIMP1-202ENST00000377017 626 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 RN7SKP102-201ENST00000411186 315 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 GAPDHP29-201ENST00000429913 985 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 LINC00700-202ENST00000438372 777 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 RPS15P5-201ENST00000449885 432 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 RPL7AP53-201ENST00000468834 793 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 CDK2AP2P2-201ENST00000478512 367 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 MIEF2-206ENST00000578174 589 ntTSL 4 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 CYP2B7P-202ENST00000593298 1087 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 ACOX2-201ENST00000302819 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC244154.1-201ENST00000620148 1555 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC104590.1-202ENST00000558368 1921 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 PRDM11-204ENST00000530656 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 IWS1-201ENST00000295321 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RPS29P62273 RORC-201ENST00000318247 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
RPS29P62273 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
RPS29P62273 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
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