Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC034238.1-214ENST00000609699 1590 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 KRT8P46-201ENST00000512037 1426 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 NNMT-201ENST00000299964 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 AL391097.1-201ENST00000432706 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 DDC-201ENST00000357936 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 PPP1R11-204ENST00000376769 1689 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 PAX6-249ENST00000639034 1597 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 C17orf64-201ENST00000269127 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 TREM2-201ENST00000338469 860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 OR10D5P-201ENST00000392760 915 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 AP001630.1-201ENST00000428410 437 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 AP000346.2-201ENST00000430707 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 AL031432.1-201ENST00000455902 988 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 LYRM7-203ENST00000510516 604 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 AC124947.1-201ENST00000552835 814 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 AC103876.1-203ENST00000565495 290 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 CXorf40A-203ENST00000422892 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 LEMD2-207ENST00000508327 1306 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 MOG-219ENST00000376898 1027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 AL365366.1-201ENST00000414898 853 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 KRT18P39-201ENST00000415349 1299 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 AP001189.3-201ENST00000531511 651 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 GLTP-205ENST00000544393 914 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 C17orf62-210ENST00000577732 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 SNRPD2-207ENST00000588599 805 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 AL590428.1-201ENST00000428865 1973 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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PTPRMP28827 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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PTPRMP28827 AP4S1-203ENST00000334725 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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PTPRMP28827 LINC01651-201ENST00000624642 350 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 AC089987.1-202ENST00000641959 426 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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PTPRMP28827 FAM95B1-211ENST00000592053 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 AL669942.1-203ENST00000610972 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRMP28827 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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