Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 PHKB-208ENST00000566044 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 DNAJC9-201ENST00000372950 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 TMEM246-202ENST00000374848 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 LRTM2-208ENST00000543818 3986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 CRHR1-206ENST00000398285 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 RGS9-203ENST00000449996 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 ZNF41-202ENST00000377065 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 TXNRD1-202ENST00000388854 4277 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 PLSCR1-201ENST00000342435 2233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 BCL2L13-214ENST00000543133 4975 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 TMEM104-204ENST00000582330 4679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 TBC1D22A-203ENST00000380995 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 AL357673.2-201ENST00000623663 4969 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 ACOT11-201ENST00000343744 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 ZNF461-201ENST00000360357 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 POTEI-201ENST00000451531 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 CAT-201ENST00000241052 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 SHMT2-201ENST00000328923 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 LINC01561-201ENST00000369071 2176 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 BX537318.2-201ENST00000624893 4162 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 PLA2G4E-AS1-201ENST00000499478 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 HAS3-202ENST00000306560 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 ZNF221-205ENST00000622072 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 STRADA-204ENST00000392950 2778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 CLDN19-201ENST00000296387 2859 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM2P07951 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM2P07951 SEZ6-202ENST00000335960 4195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM2P07951 LINC00563-201ENST00000566370 1400 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM2P07951 FGF11-202ENST00000572907 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM2P07951 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM2P07951 AIF1L-201ENST00000247291 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM2P07951 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM2P07951 GPATCH2L-209ENST00000556663 2112 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM2P07951 POM121L9P-201ENST00000414583 5018 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM2P07951 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms