Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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