Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMPOP42166 FAM183BP-201ENST00000409072 1595 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TMPOP42166 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMPOP42166 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMPOP42166 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMPOP42166 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMPOP42166 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMPOP42166 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMPOP42166 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMPOP42166 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMPOP42166 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMPOP42166 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMPOP42166 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMPOP42166 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMPOP42166 ATL2-201ENST00000378954 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMPOP42166 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMPOP42166 ZNF772-203ENST00000425074 1601 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMPOP42166 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TMPOP42166 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TMPOP42166 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMPOP42166 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TMPOP42166 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMPOP42166 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMPOP42166 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMPOP42166 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TMPOP42166 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMPOP42166 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMPOP42166 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TMPOP42166 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMPOP42166 MPPE1-204ENST00000344987 1831 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMPOP42166 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMPOP42166 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMPOP42166 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMPOP42166 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMPOP42166 UBA3-201ENST00000349511 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMPOP42166 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMPOP42166 TGM5-207ENST00000622115 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMPOP42166 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMPOP42166 GPR55-205ENST00000622008 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMPOP42166 AL359878.1-201ENST00000381466 1886 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMPOP42166 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMPOP42166 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 DDC-206ENST00000431062 1620 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 MRPL55-207ENST00000366733 834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 BICD1P1-201ENST00000457832 1222 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 AC006262.2-202ENST00000600152 333 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 GOLGA8G-203ENST00000525590 2009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 GOLGA8F-202ENST00000532622 2009 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 AC073862.3-201ENST00000624597 1648 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMPOP42166 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMPOP42166 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMPOP42166 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMPOP42166 ARSG-209ENST00000621439 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMPOP42166 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMPOP42166 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMPOP42166 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMPOP42166 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMPOP42166 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMPOP42166 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMPOP42166 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMPOP42166 VOPP1-206ENST00000428097 1671 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMPOP42166 TMUB2-205ENST00000587172 1598 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms