Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 TREH-202ENST00000397925 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 FERMT2-202ENST00000343279 3247 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 CYP11B1-203ENST00000377675 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 OR8J1-202ENST00000533152 1320 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 ZNF473-203ENST00000445728 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 ANKRD20A7P-201ENST00000402318 2414 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 L1CAM-202ENST00000361981 5004 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 ZNF75D-202ENST00000370766 5592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 UGGT2-203ENST00000376747 4832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 PAPLN-203ENST00000554301 4090 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 PEX1-204ENST00000438045 3329 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 CES1-201ENST00000360526 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 ZMPSTE24-201ENST00000372759 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 ZCRB1-201ENST00000266529 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 KCNMA1-208ENST00000372440 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 KCNMA1-233ENST00000638351 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 CBR4-202ENST00000504480 1602 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 PICART1-201ENST00000499842 2533 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 ZNF595-203ENST00000608255 1999 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 ABCB9-211ENST00000540285 3330 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 NEK11-209ENST00000510688 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 RGS16-201ENST00000367558 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 DGCR5-203ENST00000438934 5492 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 RAB6A-201ENST00000310653 3389 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 TESPA1-202ENST00000449076 2010 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 RPS6KC1-209ENST00000615329 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 PNPLA7-202ENST00000406427 4806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 PNMA3-203ENST00000619635 3627 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 ARHGEF3-213ENST00000496106 1994 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 COL11A1-210ENST00000512756 5442 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 GATAD2A-201ENST00000358713 5510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 CTAGE13P-201ENST00000416709 2446 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 NBN-201ENST00000265433 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 TRIM21-201ENST00000254436 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 PDE5A-202ENST00000354960 7154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 LMO1-201ENST00000335790 1279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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