Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 ZFAT-209ENST00000520727 4686 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 RANBP20P-201ENST00000557256 2104 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 CPEB4-207ENST00000519835 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 CDC25B-201ENST00000245960 3597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 DDX27-206ENST00000618172 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 ZFP64-202ENST00000346617 2876 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 RNF214-205ENST00000531287 1706 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 ALOX15P2-201ENST00000340858 1897 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 SLC6A12-201ENST00000359674 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 PI4KB-202ENST00000368873 3340 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 NBPF5P-201ENST00000357046 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 RECQL5-204ENST00000423245 3576 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 ACSF3-218ENST00000614302 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 SLC45A4-202ENST00000517878 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 CANT1-216ENST00000620915 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 RHD-210ENST00000622561 3007 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 HCG18-236ENST00000438412 2440 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 EME1-207ENST00000511648 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 ZP1-201ENST00000278853 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 GABRR1-201ENST00000369451 1823 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 VAV1-202ENST00000539284 2627 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AMACR-201ENST00000335606 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 DPH2-201ENST00000255108 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 ARHGEF9-221ENST00000635967 2179 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 PAX6-201ENST00000241001 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 MKX-202ENST00000419761 3638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 LVRN-201ENST00000357872 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 ERBB2-201ENST00000269571 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 ATXN2-226ENST00000608853 4376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 MARK3-201ENST00000216288 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 ZMAT4-202ENST00000315769 2250 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 STK24-201ENST00000376547 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 TRPC4-206ENST00000379705 4059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 TNS2-204ENST00000546602 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 ADPRH-201ENST00000357003 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 BEAN1-207ENST00000564819 2929 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 COPS7A-201ENST00000229251 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 PIP5K1A-203ENST00000368890 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 OSER1-AS1-202ENST00000437730 1563 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 TTI2-204ENST00000520636 1588 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 FBXO25-201ENST00000276326 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 ALDH1A2-204ENST00000537372 3700 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 INTS8-217ENST00000523731 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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