Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 MPI-208ENST00000563786 1707 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 OR51B5-201ENST00000300773 939 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 CRCT1-201ENST00000368790 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 PLA2G2A-201ENST00000375111 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 RNA5SP407-201ENST00000410275 110 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 AL133351.2-201ENST00000437718 484 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 AC006059.1-201ENST00000438017 722 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 CPSF4-206ENST00000441580 942 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 POU5F1-202ENST00000441888 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 AC008808.2-201ENST00000510349 569 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 CNOT8-217ENST00000521450 1158 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 AC044802.2-201ENST00000551187 434 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 SNHG21-205ENST00000561107 790 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 AC097634.2-201ENST00000615819 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 LSM8-201ENST00000249299 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 RPUSD4-208ENST00000533628 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 ALDH3B2-204ENST00000530069 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 CCDC33-206ENST00000558821 1993 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 LINC01649-202ENST00000634255 1743 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 SERPINA1-220ENST00000636712 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 AL031666.1-201ENST00000413818 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 PDZD11-201ENST00000239666 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 LYG2-201ENST00000333017 862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 KRTAP10-12-201ENST00000400365 873 ntAPPRIS P2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 AL512328.1-203ENST00000428480 673 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 AC131235.2-201ENST00000445553 1057 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 CMC2-202ENST00000486645 766 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 SNORD55-201ENST00000581525 80 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 AC100788.1-201ENST00000591108 945 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 AC063977.2-201ENST00000601996 421 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 AC245369.8-201ENST00000636589 306 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 DNPEP-205ENST00000373972 1578 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 BCO2-202ENST00000361053 1868 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 AC012158.1-201ENST00000535684 1366 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 LINC02140-202ENST00000566649 2017 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 AC067852.6-201ENST00000591237 1736 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 ARHGEF9-235ENST00000637723 2146 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 SIGLEC17P-204ENST00000618545 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 IKZF3-211ENST00000394189 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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TCOF1Q13428 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 AL109615.2-201ENST00000455005 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 LCE4A-201ENST00000335535 388 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 ARPC5-203ENST00000367534 622 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 NAA10-205ENST00000393712 908 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 DMKN-203ENST00000402589 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 RIBC1-203ENST00000414955 1281 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 RN7SL677P-201ENST00000466970 319 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 NUP210P2-201ENST00000510577 282 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 AC025419.1-201ENST00000537250 690 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 CD276-217ENST00000564751 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 PCP2-202ENST00000598935 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 AC021072.1-201ENST00000635789 835 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 AC114296.1-202ENST00000638019 771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 DNASE1L3-207ENST00000486455 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 PAXIP1-AS2-203ENST00000449486 2121 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 FOSB-203ENST00000443841 3346 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 GPM6B-203ENST00000356942 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 TMEM106A-204ENST00000588659 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 SH3GLB2-206ENST00000417224 1468 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TCOF1Q13428 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
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