Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 DNASE1L3-207ENST00000486455 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 PRDX1-202ENST00000319248 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 AC005220.1-201ENST00000450473 884 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 AL592463.1-201ENST00000451108 635 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 AC091965.1-201ENST00000512406 440 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 SNRPCP5-201ENST00000531775 189 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 AC092471.1-201ENST00000536497 572 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 DYNLL1P2-201ENST00000554807 270 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 SPATA8-202ENST00000558553 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 TBC1D21-203ENST00000562056 965 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 AC027281.2-201ENST00000623856 713 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 AC022748.2-203ENST00000564933 1432 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 CCDC32-214ENST00000561011 1577 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 AC244154.1-201ENST00000620148 1555 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 BTNL2-201ENST00000374993 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 PKMP1-201ENST00000455804 1523 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 ELOVL1-202ENST00000413844 1451 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 CCNH-203ENST00000504878 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 RPS16-201ENST00000251453 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 RPL30-201ENST00000287038 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 SNAPC5-202ENST00000316634 1002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 ALKBH2-202ENST00000429722 1159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 AC004771.2-201ENST00000430920 439 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 AL158824.1-201ENST00000451825 450 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 AC069181.1-201ENST00000498256 554 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 RNF139-AS1-202ENST00000519861 359 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 AC107959.3-201ENST00000520840 484 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 RN7SL405P-201ENST00000582502 289 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 NARF-IT1-201ENST00000584012 769 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 SIGLEC21P-201ENST00000598990 1010 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 TNNT3-217ENST00000641225 877 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 KIR2DL4-201ENST00000345540 1447 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 SC5D-208ENST00000534230 1861 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 OXNAD1-206ENST00000605932 1681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 KRTAP19-2-201ENST00000334055 380 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 TOMM5-202ENST00000377773 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 GYG2P1-203ENST00000382965 149 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 PPIL3-202ENST00000392283 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 PPIL3-204ENST00000409361 897 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 LANCL1-203ENST00000431941 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 AL160270.1-201ENST00000439960 631 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 RN7SL771P-201ENST00000482328 298 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 CNDP2-228ENST00000584768 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 AC092327.1-201ENST00000596612 744 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 KLK13-207ENST00000596955 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 AC007450.4-201ENST00000614709 524 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 GALNTL6-207ENST00000616459 1254 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 LYNX1-205ENST00000620006 868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 AC100774.1-201ENST00000565581 1603 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 TMPRSS13-201ENST00000430170 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 COX17-201ENST00000261070 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 RPL15P3-201ENST00000391491 615 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 AQP7P1-201ENST00000412626 1045 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 ZFR2-203ENST00000439086 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 YBX1P9-201ENST00000441264 679 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 WASH6P-207ENST00000476066 720 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 EHMT1-210ENST00000478940 591 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 RN7SL553P-201ENST00000482215 298 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 AC124254.1-201ENST00000583629 562 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 PCGF2-205ENST00000618506 1196 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRMP28827 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms