Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
USP35Q9P2H5 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP35Q9P2H5 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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