Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 DUSP11-202ENST00000443070 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 C3orf35-206ENST00000452017 513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 PAX3-205ENST00000392069 3170 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 ZNF473-203ENST00000445728 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 ARHGEF3-213ENST00000496106 1994 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 TTC4-201ENST00000371281 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AC000068.1-201ENST00000431090 2097 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 TMEM182-202ENST00000409528 3112 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 LMO1-201ENST00000335790 1279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 LINC01428-201ENST00000449581 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 LMO1-204ENST00000534484 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 RBMY1E-203ENST00000382659 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 RBMY1D-202ENST00000382680 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 RBMY1A1-203ENST00000382707 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 RBMY1B-202ENST00000383020 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 CTAGE10P-201ENST00000318353 2408 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 ZNF564-201ENST00000339282 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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