Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E2F1Q01094 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms