Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 ZNRD1-202ENST00000359374 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 SPANXD-201ENST00000370515 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 GNAS-209ENST00000371081 730 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 SMIM21-201ENST00000382638 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 POLR2H-205ENST00000443489 807 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 AC022201.1-201ENST00000452525 577 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 AC116049.1-201ENST00000505282 385 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 AC126471.1-201ENST00000550676 362 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 AC005154.1-217ENST00000584199 581 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 LINC00663-207ENST00000590092 1023 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 ARHGAP44-212ENST00000616670 884 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 MYF5-201ENST00000228644 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 PABPC1P2-201ENST00000471997 1805 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 NOMO2-210ENST00000620440 1360 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 KATNAL2-202ENST00000356157 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 C2-211ENST00000469372 1906 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 AC089987.2-201ENST00000328207 936 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 MAPT-202ENST00000334239 1107 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 IGLV4-60-201ENST00000390284 362 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 TRAV38-2DV8-201ENST00000390465 395 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 AL356481.1-201ENST00000434999 578 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 AC009404.1-202ENST00000439955 968 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 AC011005.1-201ENST00000467614 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 MESTP2-201ENST00000559787 889 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 MXRA7-206ENST00000589082 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 TSPAN16-204ENST00000590327 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 AP005264.6-201ENST00000592801 414 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 AC009542.2-204ENST00000636543 433 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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PTPRMP28827 AL139823.1-201ENST00000641871 1225 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 AC105219.4-201ENST00000529743 1809 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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PTPRMP28827 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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PTPRMP28827 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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PTPRMP28827 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 AL157414.1-201ENST00000366097 770 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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PTPRMP28827 Z93242.2-201ENST00000445666 394 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
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PTPRMP28827 C9orf147-203ENST00000460965 446 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 RBPMS-205ENST00000517860 1076 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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PTPRMP28827 CDK2AP1-204ENST00000538446 1161 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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PTPRMP28827 AC008738.4-201ENST00000590492 700 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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PTPRMP28827 Metazoa_SRP.180-201ENST00000612546 322 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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PTPRMP28827 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 CDCA7L-201ENST00000356195 2915 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 EIF4A1-225ENST00000582746 1645 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRMP28827 HNRNPC-204ENST00000449098 1599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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