Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 CACNA1C-219ENST00000399649 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 SEC14L1-204ENST00000436233 5295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 GNG4-204ENST00000450593 4978 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 SLC12A6-205ENST00000458406 4425 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 CAMSAP1-202ENST00000389532 7696 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 NBN-201ENST00000265433 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 CASC15-204ENST00000606197 3969 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 C15orf40-201ENST00000304177 11244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 KLHL23-202ENST00000392647 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 ZNF646-201ENST00000300850 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 COL11A1-210ENST00000512756 5442 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 CDC6-201ENST00000209728 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 PAPLN-203ENST00000554301 4090 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 FMNL1-202ENST00000331495 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 FER1L5-207ENST00000641731 6294 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 STARD13-202ENST00000336934 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms