Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 CCDC149-208ENST00000635206 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 ITGB1BP1-201ENST00000238091 1772 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 FPGT-202ENST00000370898 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 XYLT2-201ENST00000017003 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 AC005154.3-201ENST00000419639 1393 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 OLAH-203ENST00000378228 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 TBC1D3P1-201ENST00000590047 1693 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 TRPV1-201ENST00000310522 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 TRNAU1AP-201ENST00000373830 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NIPSNAP2O75323 LMO1-201ENST00000335790 1279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms