Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 CREB5-202ENST00000396298 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 NPM1-204ENST00000517671 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 CCL11-201ENST00000305869 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 EEF1GP3-201ENST00000421044 1288 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 DAPK1-IT1-201ENST00000431813 702 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 Z84721.1-201ENST00000438841 372 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 AC109466.1-203ENST00000524297 1083 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 SPATA8-AS1-202ENST00000560888 392 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 PEX11A-204ENST00000561224 529 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 ZNF30-AS1-201ENST00000604333 625 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 AL139260.3-204ENST00000621281 609 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 TMUB2-205ENST00000587172 1598 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 NLK-203ENST00000582037 1503 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 SPATA22-203ENST00000397168 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 CACNA1G-AS1-202ENST00000505793 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 ASLP1-201ENST00000428790 637 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 MTND6P11-201ENST00000431890 483 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 FLNC-AS1-201ENST00000469965 559 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 TRBV11-2-201ENST00000471935 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 RN7SL452P-201ENST00000482923 291 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 AC105424.1-201ENST00000514583 209 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 AC087627.1-201ENST00000522339 993 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 AL110292.1-201ENST00000550024 477 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 AL132780.2-203ENST00000555294 589 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 DCTN5-204ENST00000563998 878 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 AC027682.3-201ENST00000564717 207 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCDH10Q9P2E7 AC142381.4-201ENST00000566806 702 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms